哈尔滨医科大学由原哈尔滨医科大学（其前身为1926年伍连德博士建立的哈尔滨医学专门学校）和原兴山中国医科大学第一、二分校（其前身为1931年在江西瑞金建立的中国工农红军卫生学校）合并组建而成，具有悠久历史和光荣传统。学校传承伍连德博士“赤诚爱国、自强创业”的精神，发扬中国工农红军卫校“政治坚定、技术优良”的校风，经过79年创建和发展，成为具有相当规模和鲜明特色的医学院校，是黑龙江省重点建设的“211工程”院校。
学校占地面积125万平方米，建筑面积98.6万平方米。全校教学科研仪器设备总值1.6亿元。建有完备的校园计算机信息网络。图书馆馆藏图书84万册、期刊2346种(外文原版期刊714种)、中英文全文电子期刊3万种、中英文电子图书22万册，可提供电子文献检索和网络信息服务。
设有基础医学院、公共卫生学院、药学院、第一至第四临床医学院（即附属医院）、口腔医学院、护理学院、卫生管理学院、研究生学院、成人教育学院（继续教育学院）、生物信息系、人文社会科学系、体育学部等附属单位。
国家理科基础科学研究与教学人才培养基地、中国疾病预防控制中心地方病控制中心、国家新药临床试验研究中心、卫生部俄语培训中心、中国医学科学院黑龙江分院、黑龙江省医学科学院等设在我校。
拥有一级学科博士学位授权点4个（基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、生物学）、二级学科博士学位授权点41个、硕士学位授权点47个；博士后科研流动站5个、博士后科研工作站2个；国家级重点学科1个、省级重点学科20个；省部共建生物医药工程国家重点实验室培育基地1个、部省级重点实验室4个、省普通高校重点实验室7个；国家特聘教授岗位学科1个、省特聘教授岗位学科20个。
全校教职工8617人，教师2471人。其中，专任教师552人（教授155人、副教授105人、讲师119人、助教173人）。教师中，有中国工程院院士1人；国务院学位委员会学科评议组成员3人；全国医学专业学位教育指导委员会委员2人；博士生导师193人，硕士生导师508人；享受政府特殊津贴专家102人，其中享受国务院特殊津贴专家95人。
有各类在校学生9947人。其中，博士、硕士研究生2086人，本科生5496人，成人教育学生2365人。建校以来，培养学生近4万人，毕业生遍布国内外，涌现出一批知名专家学者。
2000年以来，学校共承担省部级以上科研课题933项，其中“973”前期研究专项1项、“973”子课题1项、“863”子课题3项、“十五”国家科技攻关计划引导项目1项、“十五”国家科技攻关计划子课题2项、国家自然科学基金重点项目2项、国家杰出青年科学基金1项、国家自然科学基金项目162项（面上项目138项）；获省部级以上科技成果奖205项，其中国家自然科学二等奖3项（合作项目2项）、国家科技进步二等奖3项；在国内外有较大影响的研究项目包括：“实体瘤的细胞遗传学研究”、“系列性脾保留性手术的基础与临床研究”、“全反式维甲酸与三氧化二砷治疗恶性血液疾病的分子机制研究”、“同种原位心脏移植的实验和临床应用研究”、“抗心律失常药物作用的离子通道靶点研究”和“中国北方不同民族基因库的建立、保存与多样性研究”；主编《中国地方病学杂志》、《国外医学·遗传学分册》、《国外医学·免疫学分册》等6种专业期刊；先后同美国、日本、加拿大、澳大利亚、俄罗斯等15个国家的40余所院校建立了友好校际关系。
四所附属医院（第一至第四临床医学院）均为“三级甲等”医院，其中附属第一、第二、第四医院被卫生部授予全国“百佳医院”。四所附属医院和口腔医学院现有开放床位4788张。同种异体劈裂脾移植、心脏移植、双手移植、单前臂移植等移植领域和大肠癌的综合治疗等在国内有较大影响。
