桑顶寺位于羊卓雍错湖西南一座险要陡峭的山顶上，属藏传佛教噶举派香巴噶举支派，是一座有300多年历史的古老寺庙。
据《宗教源流镜史》记载，由香巴噶举创始人琼波南觉的四传弟子克尊·旬所建；另一说为15世纪初由博东巴·乔列南杰（1375-1451）所建，为僧尼合住寺院，由西藏唯一的女活佛多吉帕姆住持，多吉帕姆（意译为“金刚亥母”）女活佛转世传承，至今已传12世。其中，二世女活佛为六世班禅罗桑丹贝益西的侄女，十二世女活佛多吉帕姆德庆曲珍现为西藏自治区政协副主席、全国政协委员、全国人大代表。
该寺18世纪曾有僧尼80名，本世纪初近200人，后不断减少，女活佛多吉帕姆被认为印度金刚亥母的肉身再现，倍受信徒敬仰，寺内供有历辈多吉帕姆的肉身。寺内主修金刚亥母密法，修炼印度瑜伽密宗。桑丁寺刚修建时只是个小寺，二世多吉帕姆贡噶桑姆在仁蚌巴、雅桑万户长和羊卓万户长等人的资助下，扩建了桑丁寺。五世多吉帕姆卡居白姆维修和扩建了桑丁寺诸佛堂，并新造了佛像、佛塔等。
